怎样使用ncbi搜索并下载基因序列,NCBI的Blast怎么用

ncbi查找全基因组 2023-12-03 11:22 691 墨鱼

ncbi查找全基因组

怎样使用ncbi搜索并下载基因序列,NCBI的Blast怎么用

下面介绍几种获取mRNA序列的方法。 1.第一种方法是NCBI：在百度搜索NCBI。第一个搜索结果是官方网站。点击官方网站进入主界面。在主页的"所有数据库"选择框中选择"Nucleotide1"。搜索：登录NCBI界面，点击下拉菜单。在菜单中选择核苷酸，复制上面准备的整个序列号文件，然后将其粘贴到核苷酸搜索框中。搜索结果如下所示（20个序列）：2.快速序列下载：点击

首先打开NCBI，在搜索框中选择[基因组]，然后输入要下载的物种的拉丁名。如果NCBI没有包含该物种的基因组信息，例如输入芥末、Brassicajuncea的拉丁名，搜索结果如下：1.打开NCBI官方网站页面，在页面顶部的搜索框中，选择您要下载的基因序列类别，在此处选择"核苷酸"选项。 2、接下来，输入具体的名称。这里输入的是Kinase，它代表一种酶。然后点击"搜索"按钮即可显示

输入https://ncbi.nlm.nih/，在左侧下拉菜单中选择"Assembly"，输入刚刚找到的基因组编号：03。搜索下载：点击搜索，进入基因组的组装信息界面。可以看到，只有基因组进入了GenBank，没有进入RefSeq1。下载单个基因的蛋白质序列（某个转录本）：---查找蛋白质序列（NP_xxx）)对应于指定的转录本(NM_xxx)a.根据NCBI中的基因名称- 基因数据库查找基因并按ctrl+查找基因的详细页面

通过Python包下载ncbi-genome-download。这个Python包可以帮助我们在Linux等终端上下载序列文件，而无需打开网站。这个包的原理是通过ENTREZAPI接口从GenBank/R01下载。首先，我们打开NCBI官方网站页面，在页面顶部的搜索框中选择要下载的基因序列类别，这里需要选择"核苷酸"选项。 02接下来，我们需要输入一个具体的名称。这里输入Kinase，它代表一种酶。

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标签： NCBI的Blast怎么用