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以cDNA为模板扩增基因 |
以cdna为模板设计引物,PCR引物设计
>▽< 使用材料和方法中给出的引物进行后续的qPCR实验;如果没有报告,则必须先确定目标基因的mRNA序列。对于有参考的物种,可以直接在GenBank数据库中查看准确的mRNA序列。对于没有参考的物种,必须先通过高通。 定量测序检测部分04qPCR引物设计最好以DNA为模板设计qPCR引物。与普通引物设计一样,最佳PCR产物长度在100-200bp之间。 以cDNA为模板的qPCR引物设计需要排除基因组污染,因此设计时
1.引物最好设计在模板cDNA的保守区域内。 DNA序列的保守区域是通过物种间相似序列的比较来确定的。 在NCBI上搜索不同物种中的相同基因,并通过序列分析软件(如DNAman)进行比对(Alignment)。稍后当我们选择引物覆盖时,我们将覆盖这一部分。打开网站https://ncbi.nlm.nih/tools/primer-blast/填写参数并点击"GetPrimer"并等待1-5分钟。
>0< 想想它是双链设计。 另一个引物对应于虚拟互补链。 当PCR进行时,第一个循环后会出现互补链。 首先,引物必须与模板紧密结合,其次,引物之间必须有稳定的二聚体或发夹结构,第三,引物不得在其他非目标位点引起DNA聚合(即错配)。 基于这些基本原则,
1.3PCR设计根据已知的小片段基因序列设计正向和反向引物,并分别与cDNA文库中的载体引物T7/SP6配对。 以胎肝cDNA文库为模板进行PCR,琼脂糖凝胶扫描并用年龄成像仪成像对PCR产物进行分析。 960化工网>2024年化工行业问答日历,免费领取! 设计qPCR引物时,使用mRNA还是cDNA作为模板? 网友1回答等你回答:优质人内质网氨基肽酶2(ERAP2)ELISA试剂盒产品价格偏高
1)引物最好设计在模板cDNA的保守区域内。 2)引物长度一般在15-30个碱基之间。 3)引物的GC含量在40%~60%之间,Tm值优选接近72℃。 4)引物的3'端应避免第三个密码子。当然,这是cDNA。mRNA在被切割之前可能有内含子。如果你的基因没有内含子,无论是DNA还是cDNA都没有关系。 看不懂分析? 免费观看类似问题的视频分析以查看答案和更多答案
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标签: PCR引物设计
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