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NCBI上怎么看全基因组 |
ncbi查找某个物种的全基因组,用ncbi已知蛋白序列找基因
02.搜索基因:您可以输入基因ID(NCBIGeneID是GI编号)或基因名称进行搜索。 这里我们以mousecryptochromegene为例,我们直接输入cryptochrome进行搜索,结果如下:03.查找顺序1.此时,你只需要输入物种名称Arabidopsis的第一个单词(二项式法中的属,这里为(Arabidopsis),选择Taxonomy(分类),点击搜索:2.点击属名"Arabidopsis":3.现在你就可以知道最接近的了您正在寻找的物种来源
∪△∪ 1.此时,您只需输入物种名称Arabidopsis的第一个单词(二项式方法中的属,这里是Arabidopsis),选择Taxonomy(分类),然后单击搜索:2.单击属名"拟南芥":3.现在您可以进行基因组分析;在搜索框中输入该物种的拉丁名"Plutellaxylostella",然后单击搜索跳转到NCBI推荐的基因组.此基因组一般是组装结果较好或注释信息完整的基因组;您也可以查看ComeHere
2.叶绿体基因组的全局比较(mVISTA)和线性块比较(Mauve)3.搜索高变区(DnaSPv.5)4.不同物种的重复序列基因的所有序列,可以找到该物种链霉菌,如果我找人,应该是:SOTTHUMT保守域(1)摘要GenBank和FASTA可以检查如何
选择基因组搜索数据库;在搜索框中输入物种的拉丁名"Plutellaxylostella",点击搜索跳转到NCBI推荐的基因组。该基因组一般是组装结果良好或注释信息完整的基因组;还可以看到第一对基因源的注释,如下图。 4.接下来是基因所在基因组的图形描述(如下图)。您可以直观地看到其基因组信息。例如,6q25.1表示25.1在第六条染色体上的位置,NC_00000。
在NCBI的基因组数据库(Genome)中,搜索物种基因组结果并下载。 在如下搜索栏中选择"基因组",并在搜索关键字中输入"物种名称",例如"巨大芽孢杆菌"。 如果该物种已进行全基因组测序,则可能需要表达该物种的特定蛋白质或基因。2.序列获取方法:1.打开NCBI网站(https://ncbi.nlm.nih)2.单击下图中红色箭头所示的下拉框3.找到"基因",如下图所示4.选择"基因"
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标签: 用ncbi已知蛋白序列找基因
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